Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgbl1Q8VDV0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgbl1Q8VDV0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgbl1Q8VDV0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms