Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD26

Tmem143, Transmembrane protein 143, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem143Q8VD26 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem143Q8VD26 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem143Q8VD26 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem143Q8VD26 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem143Q8VD26 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem143Q8VD26 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem143Q8VD26 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem143Q8VD26 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem143Q8VD26 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem143Q8VD26 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem143Q8VD26 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms