Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc9Q8VC31 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc9Q8VC31 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc9Q8VC31 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms