Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ApobrQ8VBT6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ApobrQ8VBT6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ApobrQ8VBT6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms