Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc12Q8R344 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc12Q8R344 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms