Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f4Q8R0K9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.33■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f4Q8R0K9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms