Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vstm2aQ8R0A6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2aQ8R0A6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms