Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MyripQ8K3I4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MyripQ8K3I4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms