Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssh3Q8K330 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssh3Q8K330 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms