Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncapd2Q8K2Z4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncapd2Q8K2Z4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd2Q8K2Z4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms