Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stn1Q8K2X3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stn1Q8K2X3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Stn1Q8K2X3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stn1Q8K2X3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Stn1Q8K2X3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Stn1Q8K2X3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stn1Q8K2X3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms