Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q0

Commd9, COMM domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd9Q8K2Q0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Commd9Q8K2Q0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Commd9Q8K2Q0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms