Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trappc12Q8K2L8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trappc12Q8K2L8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms