Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hacd3Q8K2C9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hacd3Q8K2C9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hacd3Q8K2C9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hacd3Q8K2C9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hacd3Q8K2C9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hacd3Q8K2C9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms