Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fcho1Q8K285 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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Fcho1Q8K285 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Fcho1Q8K285 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Fcho1Q8K285 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Fcho1Q8K285 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Fcho1Q8K285 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Fcho1Q8K285 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Fcho1Q8K285 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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Fcho1Q8K285 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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