Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arfip2Q8K221 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arfip2Q8K221 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms