Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spire2Q8K1S6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spire2Q8K1S6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms