Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmbrd1Q8K0B2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmbrd1Q8K0B2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms