Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpne5Q8JZW4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cpne5Q8JZW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms