Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rasgef1bQ8JZL7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rasgef1bQ8JZL7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms