Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CopaQ8CIE6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CopaQ8CIE6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CopaQ8CIE6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms