Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klf17Q8CFA7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klf17Q8CFA7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms