Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9030612E09RikQ8CE20 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9030612E09RikQ8CE20 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms