Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc178Q8CDV0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc178Q8CDV0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms