Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CrebrfQ8CDG5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CrebrfQ8CDG5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms