Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp20Q8C6M1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp20Q8C6M1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp20Q8C6M1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Usp20Q8C6M1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Usp20Q8C6M1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp20Q8C6M1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Usp20Q8C6M1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Usp20Q8C6M1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp20Q8C6M1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp20Q8C6M1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp20Q8C6M1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp20Q8C6M1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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