Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim35Q8C006 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim35Q8C006 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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