Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift57Q8BXG3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ift57Q8BXG3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift57Q8BXG3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift57Q8BXG3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift57Q8BXG3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift57Q8BXG3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift57Q8BXG3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift57Q8BXG3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift57Q8BXG3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ift57Q8BXG3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms