Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Actrt3Q8BXF8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Actrt3Q8BXF8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179 ms