Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctdsp2Q8BX07 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctdsp2Q8BX07 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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