Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TtpaQ8BWP5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TtpaQ8BWP5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms