Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPI1

Dnaaf2, Protein kintoun, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf2Q8BPI1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf2Q8BPI1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dnaaf2Q8BPI1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms