Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gga3Q8BMI3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gga3Q8BMI3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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