Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc2Q8BKV1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpc2Q8BKV1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gpc2Q8BKV1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gpc2Q8BKV1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc2Q8BKV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc2Q8BKV1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc2Q8BKV1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc2Q8BKV1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc2Q8BKV1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpc2Q8BKV1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms