Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lrrtm2Q8BGA3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms