Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnpo1Q8BFY9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnpo1Q8BFY9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms