Protein–RNA interactions for Protein: Q810F0

Prima1, Proline-rich membrane anchor 1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prima1Q810F0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prima1Q810F0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prima1Q810F0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms