Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Amigo1Q80ZD8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Amigo1Q80ZD8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms