Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnupnQ80W37 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnupnQ80W37 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms