Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc1Q80VQ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Lrrc1Q80VQ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Lrrc1Q80VQ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Lrrc1Q80VQ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Lrrc1Q80VQ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrc1Q80VQ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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