Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rab3gap1Q80UJ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rab3gap1Q80UJ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab3gap1Q80UJ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rab3gap1Q80UJ7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3gap1Q80UJ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3gap1Q80UJ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rab3gap1Q80UJ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms