Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otop3Q80UF9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms