Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Avl9Q80U56 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms