Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Igsf5Q7TSN7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Igsf5Q7TSN7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Igsf5Q7TSN7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Igsf5Q7TSN7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Igsf5Q7TSN7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Igsf5Q7TSN7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Igsf5Q7TSN7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Igsf5Q7TSN7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Igsf5Q7TSN7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Igsf5Q7TSN7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Igsf5Q7TSN7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Igsf5Q7TSN7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Igsf5Q7TSN7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms