Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pkd1l2Q7TN88 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkd1l2Q7TN88 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pkd1l2Q7TN88 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms