Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HhipQ7TN16 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HhipQ7TN16 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HhipQ7TN16 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HhipQ7TN16 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HhipQ7TN16 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms