Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1cQ76I25 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1cQ76I25 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms