Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SynmQ70IV5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SynmQ70IV5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SynmQ70IV5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms