Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trpv1Q704Y3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpv1Q704Y3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms