Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2d2bQ6ZWY6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms